本书是“面向21世纪课程教材”《环境工程微生物学》的第五版，是环境工程专业核心课程教材。全书共分三篇，第一篇为微生物学基础，介绍非细胞结构的超微生物——病毒，包括病毒的分类与命名、个体的特殊结构、遗传物质、繁殖方式、遗传变异及其致病性等；病毒的传播、危害、对策与应用；具有细胞结构微生物的个体、群体特征及特征识别，生理生化特性，生长特征；对环境工程极有意义的古菌、极端环境微生物；分子生物学、遗传变异和分子遗传学基本原理；现代分子生物学、分子遗传学技术在环境保护与环境工程中的应用。

第二篇为微生物生态与环境生态工程中的微生物作用，介绍在环境工程中各种生物处理方法的微生物机理，重点介绍关于水体富营养化的有机物降解、硝化、反硝化、脱氮、除磷机理新概念和新工艺选择；应用微生物学的基础知识分析和解决工程中发现的问题；介绍固定化微生物、微生物絮凝剂、沉淀剂及微生物能源的开发与应用。

第三篇为环境工程微生物学实验，其内容紧密配合课程教学，同步进行，反映基础性、可操作性、综合性和实用性。

全书体现理论与实践相结合，及时反映和应用前沿边缘学科的新技术，内容丰富、图文并茂，是高等学校的环境科学、环境工程和给排水科学与工程等专业的教材，也可作为微生物学专业的学生及科研人员的参考书。

前辅文
绪论
  第一节 环境问题与微生物的作用
  第二节 环境工程微生物学的研究对象和任务
   一、环境工程微生物学的研究对象
   二、环境工程微生物学的研究任务
  第三节 微生物的概述
   一、具细胞结构微生物的分类和命名
   二、非细胞结构微生物的分类和命名
   三、原核微生物与真核微生物
   四、微生物的特点
  第四节 微生物与人类安全
   一、致病生物因子
   二、珍惜人的生命，反对制造、使用生物武器
   三、正确使用生物资源和转基因技术
  思考题
第一篇 微生物学基础
  第一章 非细胞结构的超微生物——病毒
   第一节 病毒的一般特征及其分类
   第二节 病毒的形态和结构
   第三节 病毒的繁殖
   第四节 病毒的测定与培养
   第五节 病毒对物理、化学因素和抗生素的抵抗力及污水处理过程对病毒的去除效果
   第六节 病毒的危害、对策与应用
   思考题
  第二章 原核微生物
   第一节 古菌域
   第二节 细菌域
   第三节 蓝细菌
   第四节 放线菌
   第五节 其他原核微生物
   思考题
  第三章 真核微生物
   第一节 原生动物
   第二节 微型后生动物
   第三节 藻类
   第四节 真菌
   思考题
  第四章 微生物的生理
   第一节 微生物的酶
   第二节 微生物的营养
   第三节 微生物的能量代谢
   第四节 微生物的合成代谢
   思考题
  第五章 微生物的生长繁殖与生存因子
   第一节 微生物的生长繁殖
   第二节 微生物的生存因子
   第三节 其他不利环境因子对微生物的影响
   第四节 微生物与其他生物之间的关系
   第五节 菌种的退化、复壮与保藏
   思考题
  第六章 微生物的遗传和变异
   第一节 微生物的遗传
   第二节 微生物的变异
   第三节 基因重组
   第四节 突变体的检测与筛选
   第五节 分子遗传学新技术在环境工程与环境保护中的应用
   思考题
第二篇 微生物生态与环境生态工程中的微生物作用
  第七章 微生物的生态
   第一节 生态系统概述
   第二节 土壤微生物生态
   第三节 空气微生物生态
   第四节 水体微生物生态
   思考题
  第八章 微生物在环境物质循环中的作用
   第一节 氧循环
   第二节 碳循环
   第三节 氮循环
   第四节 硫循环
   第五节 磷循环
   第六节 铁循环
   第七节 锰循环
   第八节 汞循环
   思考题
  第九章 水环境污染控制与治理的生态工程及微生物学原理
   第一节 污（废）水生物处理中的生态系统
   第二节 活性污泥丝状膨胀的成因及控制对策
   第三节 厌氧环境中活性污泥和生物膜的微生物群落
   思考题
  第十章 污（废）水和微污染水源水生物处理的微生物学原理及其深度处理
   第一节 污（废）水生物脱氮除磷与微生物学原理
   第二节 微污染水源水生物处理中的微生物学原理
   第三节 人工湿地中微生物与水生植物净化污水的作用
   第四节 污水处理的抗生素抗性基因扩散与控制方法
   第五节 饮用水的消毒与其微生物学效应
   思考题
  第十一章 有机固体废物与废气的微生物处理及其微生物群落
   第一节 有机固体废物的微生物处理及其微生物群落
   第二节 废气的生物处理
   思考题
  第十二章 微生物学新技术在环境工程中的应用
   第一节 固定化酶和固定化细胞在环境工程中的应用
   第二节 微生物细胞外多聚物的开发与应用
   第三节 优势菌种与微生物制剂的开发与应用
   第四节 生物能源与微生物产能及捕碳
   思考题
第三篇 环境工程微生物学实验
  第十三章 环境工程微生物学实验
   前言
   实验注意事项
   实验一 细菌、放线菌和蓝细菌个体形态的观察及富营养化水体中微生物的观察与分析
   实验二 酵母菌、霉菌、藻类的个体形态观察及活性污泥中生物相的观察与分析
   实验三 微生物细胞的计数和测量
   实验四 细菌的简单染色和革兰氏染色
   实验五 细菌淀粉酶和过氧化氢酶的定性测定
   实验六 培养基的配制和灭菌
   实验七 细菌的纯种分离、培养和接种技术
   实验八 纯培养菌种的菌体、菌落形态的观察
   实验九 总大肠菌群的检验
   实验十 细菌菌落总数的测定
   实验十一 耐热大肠菌群的测定
   实验十二 水体（生活污水）中的微生物检测与水质评述
   实验十三 应用API20E细菌鉴定系统鉴定肠杆菌科和其他革兰氏阴性杆菌
   实验十四 噬菌体的分离与纯化
   实验十五 噬菌体效价的测定
   实验十六 空气中微生物的测定
   实验十七 富营养化水体藻量的测定（叶绿素a法）
   实验十八 发光细菌的环境毒性检测实验
附录
  附录一 教学用染色液的配制
   一、普通染色法常用染液
   二、革兰氏（Gram）染液
   三、芽孢染色液
   四、荚膜染色液
   五、鞭毛染色液（方法之一）
   六、鞭毛染色液（方法之二）
   七、乳酸石炭酸棉蓝染色液（观察霉菌形态用）
   八、聚β-羟基丁酸染色液
   九、异染颗粒染色液
  附录二 几种常用染色方法
   一、简单染色法
   二、革兰氏染色法
   三、芽孢染色法
   四、荚膜染色法（墨汁背景染色法）
   五、鞭毛染色法
   六、聚β-羟基丁酸（类脂粒、脂肪球）染色
   七、异染颗粒染色
  附录三 教学用培养基
   一、肉膏蛋白胨琼脂培养基
   二、LB培养基
   三、查氏（蔗糖琼脂）培养基
   四、马铃薯培养基
   五、高氏Ⅰ号培养基（淀粉琼脂培养基）
   六、麦芽汁培养基
   七、明胶培养基
   八、蛋白胨培养基
   九、肉膏胨淀粉琼脂培养基
   十、亚硝化细菌培养基
   十一、硝化细菌培养基
   十二、反硝化（硝酸盐还原）细菌培养基
   十三、反硫化（硫酸盐还原）细菌培养基
   十四、浮游球衣菌培养基
   十五、培养红串红球菌NOC-1的适宜培养基
   十六、红螺菌科细菌分离培养基
   十七、无氮培养基（培养自身固氮细菌用）
   十八、油脂培养基
   十九、CMC培养基（培养纤维分解菌用）
   二十、分离、扩增噬菌体试验用培养基
   二十一、发光细菌培养基
  附录四 关于加压蒸汽灭菌法的注意事项
   一、常用灭菌压力、温度与时间
   二、空气排除程度与温度的关系
   三、灭菌温度和时间的设置
  附录五 显微镜的保养
  附录六 大肠菌群检索表（MPN法）
主要参考文献